（1）底肥秋施深度可达25厘米以上易被作物根系吸收，从而提高了肥料的利用率，同时农家肥深施以后，可以在土壤深层腐熟，活化深层土壤微生物，对改良土壤起到了明显作用。
（2）秋施底肥有利于保护土壤墒情，底肥秋施后，增加了土壤孔隙度，增大了田间持水量，冬春季保墒效果好。
（3）有利于保全苗，由于秋施底肥，使大部分化肥翻入土壤的深层和中层，春播时表层化肥量相应的减少，种子周围化肥浓度降低，种子出苗率提高，因而有利于保全苗。
（4）增强作物的抗倒伏能力，农作物的根系发育具有很强的向肥性，秋季深施底肥与春播前浅施底肥相结合，使肥料在土壤上中下层均匀分布，有利于作物纵向横向伸展。根系发达，吸水吸肥能力强，作物抗倒伏抗旱能力显著增强，同时有效防止作物中后期脱肥早衰，具有显著的增产增收效果。
（5）缓解农时，利用秋翻地深施底肥，春季可以缓解劳动力紧张的状况。